Na dyskietce bowiem znajduje się DOS-owy program FDISK

Jeśli używamy względnie przyjaznej metody modyfikowania ustawień twardego dysku, otrzymamy jedną dużą partycję. Jeśli na tym nam zależy, to dobrze. Jeżeli jednak chcielibyśmy podzielić dysk na kilka partycji, trzeba zresetować komputer i uruchomić go z dyskietką startową Windows (zamiast dysku CD). Na dyskietce bowiem znajduje się DOS-owy program FDISK. Po uruchomieniu komputera i wczytaniu systemu z dyskietki należy nacisnąć klawisz F3, by opuścić program instalacyjny Windows, po czym uruchomić wspomniany program FDISK. W przeciwieństwie do instalacji programu Windows, FDISK przyjmuje domyślnie ustawienie obsługi dużych dysków. W tym punkcie wystarczy nacisnąć Enter. Po wyświetleniu następnego ekranu należy nacisnąć Enter dwukrotnie: dzięki temu przejdziemy do ekranu tworzenia partycji podstawowej. Jeśli chcemy utworzyć kolejną partycję (generalnie nie zaleca się tworzenia więcej niż dwóch), rozmiar pierwszej ustawiamy na dowolną wartość poniżej maksymalnej. Wskazane jest przy tym zróżnicowanie rozmiarów obu partycji, a wybór która będzie większa jest dowolny. Dla dysków powyżej 10 GB zalecamy zachowanie proporcji 2:1. Kiedy wykonamy już opisane wyżej czynności, powtórzmy catą procedurę poza procedurą tworzenia partycji rozszerzonej. Dla drugiej partycji przeznaczmy całą pozostałą przestrzeń dyskową. Kiedy wykonamy i to możemy uruchomić komputer, tym razem używając dysku CD. Program instalacyjny wykona formatowanie podzielonego dysku.
Ostatnia uwaga: istnieją narzędzia, takie jak Partition Magie czy Partintion-lt, które umożliwiają zmianę konfiguracji i podział partycji bez konieczności ponownego formatowania dysku, a co za tym idzie, utraty danych (o ile dysk nie jest pełny). Partition Magie może ponadto pomóc w konfigurowaniu partycji niewindowsowych, przeznaczonych dla innych systemów operacyjnych.